武汉大学水利水电学院拥有水利工程一级学科博士学位授予权和土木水利专业硕士学位授予权，共有7个工学博士点、9个工学硕士点，土木水利专业学位博士点，土木水利和工程管理2个专业学位硕士点。

学院目前在校研究生共987人，其中留学生18人。现有博士研究生导师91人（其中兼职导师20人），硕士研究生导师68人。

学院现通过硕博连读、直博生、考核选拔等多种方式招收博士研究生，近三年博士招生规模每年约100人；通过推荐免试和全国统考招收全日制硕士研究生（包括全日制学术学位硕士研究生和全日制专业学位硕士研究生），通过全国统考招收非全日制专业学位硕士研究生，近三年硕士招生规模每年约250人。

学院近三年共派出46名研究生出国联合培养或攻读学位；2016年开始，学院与南京水利科学研究院联合培养博士研究生，截至目前已招收共40名联合培养博士研究生；学院与长江水利委员会长江勘测规划设计研究院等11家单位建立了研究生实习实践基地，为研究生提供了良好的实习实践平台。